怎样修习药师咒
药师佛的真言就是药师佛对众生的大悲。当修习者持诵药师佛真言时所持诵的就是药师佛的声音。修习者持诵药师真言的时候，一定要以药师佛的心、气脉、呼吸来持诵。
当修习者持诵药师真言的时候，一定要以药师佛的心、气脉、呼吸来持诵。
首先，修习者要知道：药师佛的脉轮是完全放松的，而众生的脉轮却是纠结缠绕的。因此，在持诵的时候，要先将体内的脉轮完全放松，用清净的心来持咒，并且要领悟到一切声音都是药师佛的声音，脉轮才会渐渐放松。
要修行者持诵药师咒的时候，要知道所有的声音都是药师咒的咒音，这就是诸佛的声音瑜伽，一切声音都是药师佛法的流行。当修行者知道所有的声音都是药师佛的声音以后，所发出的任何声音都是药师佛的声音，可以说是药师佛通过修行者发出声音。因此当修行者持诵药师佛真言时，即是药师佛通过修行者颂出真言。
药师佛的真言就是药师佛对众生的大悲，当修行者来持诵药师佛真言时所持诵的就是药师佛的声音，就像“入我我入”的方法，药师佛进入修行者自身而持诵真言，同时，我们也入于药师佛来持诵真言。当修行者观想自己入于药师佛的时候，就是药师佛的代表，不是以凡夫之身来念诵，而是药师佛在诵咒，这也是与药师佛相感应的瑜伽方法。所以，当修行者理解药师佛的真言，药师佛的心越多，真言的力量就越大。
心、气、脉、身、境的诵念法
首先，把心放轻松，安住自性，没有妄想，也不昏沉。
其次，把呼吸逐渐放轻松，想象呼吸具足药师佛的大愿，每一个呼吸都是清净琉璃光明的，进入体内。
然后，将顶轮放空，观想药师佛住于自己的顶轮，安坐于千叶宝莲之上；想象药师佛慢慢从顶轮降到眉心轮，从顶轮到眉心轮这段中脉就清楚地开启了；想象药师佛慢慢从眉心轮降到喉轮，从顶轮到眉心轮到喉轮的这段中脉就清楚地开启了；想象无边无际的光明脉轮，所有的骨头、肌肉都化成了无数微小药师佛，成为无量的光明；想象药师佛从喉轮降到心轮，从顶轮到眉心轮到喉轮、心轮，这段中脉就清楚地开启了；想象药师佛慢慢从心轮降到脐轮，从顶轮、眉心轮、喉轮、心轮到脐轮，这段中脉就清楚地开启了；想象药师佛慢慢从脐轮降到海底轮，从顶轮、眉心轮、喉轮、心轮、脐轮到海底轮，这段中脉就清楚地开启了。现在身体内的中脉完全开启了，每一个细胞都能产生共鸣，不断地扩散出去。修行者的呼吸都化成药师佛，沿着中脉吸入、呼出。而在海底轮处有药师佛安住，修行者的呼吸就是药师佛的呼吸。诵咒时就从位于海底轮的药师佛发出声音，最后收下颚，从大椎骨、肩胛骨放下。
观想药师佛在药师净土的诵念法
想象顶上虚空的药师佛，慢慢地向上升高，从药师琉璃净土发出声音。
从大地或中脉延伸至地底无限远发出咒音
想象药师佛的声音从地底或中脉逐渐延伸至地底，直至无限遥远，发出药师佛的清净咒音。
从身体各个部位发出咒音，身体所有的毛孔、细胞都发出共鸣
想象身体所有的部位、所有的器官都能发出咒音，甚至于身体的每一个细胞、每一个毛孔都能发出共鸣。
从体内不同部位持咒
左右脉的声音是旋转的声音，从肋下发出声音，从脊背发出声音，从脊椎的尾闾发出声音。
从身外的境诵咒
从眼前所看的任何一种景物，或其他景象、物体诵咒。高山是药师佛的咒音，河水是药师佛的咒音……地、水、火、风、空都是药师佛的咒音，整个山河大地都是药师佛的咒音。
所有的声音都是药师咒的咒音
想象身在水中，或身如杨柳般柔软。每一骨头、关节、内脏都像气球一样被气体充满。想象药师佛从顶轮到眉心轮，从眉心轮到喉轮，从喉轮到心轮，从心轮到脐轮，从脐轮到海底轮，从海底轮往下降至无限远。所有的细胞都像一个太阳一样亮了起来。 让声音自己诵咒，声音就是药师佛。
这时修行者的咒音具有慈悲与智慧，都是药师佛的声音。听闻者就是听到药师佛的声音，用声音成就佛事，而且希望听闻者都能成就无上菩提，一切山河大地都是圆满净土，就像药师佛的十二大愿一样，这就发出了慈悲的药师咒咒音，它能从过去穿透现在、未来，从现在穿透过去、未来，所有地、水、火、风、空的声音，全部都是觉醒的声音。
《药师咒》咒文：
南无薄伽伐帝 鞞杀社 窭噜薜琉璃 跋喇婆 喝啰阇也 怛他揭多也 阿啰喝帝 三藐三勃陀耶 怛侄他 唵 鞞刹逝 鞞刹逝 鞞刹社 三没揭帝莎诃
诵念药师咒的作用：
修持读诵药师咒能拔一切业障、护持身心安康、得无量福慧。
诵持真言是一种很柔软温和的方法，修得好，一字音中即能“一言具众音声海”。在烦恼痛苦的时候，放开一唱，就会得到解脱。我们可以通过唱念、持咒，震发我们的三脉七轮，打通中脉，透过法界。
念诵药师真言可以震动身体内部的气脉，使他发挥生命的潜能，超越惯有的现象而进入神妙的领域，甚至启发人体特异功能和高度智慧。药师佛真言的最大秘密就在于声音和人体气脉的关系，专心诵持药师佛的真言会把身体的三脉七轮都震开，能一下就进入音声海三昧中。药师佛认为这种功能是众生本来就具有的，只是潜藏在人体中需要特殊的机会来激发出来。
（来源：《图解药师经》）
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持咒时，大脑怎么运作？
从 1970 年代开始，美国脑神经科学专家、医师相继透过电脑扫描、造影，研究禅修者禅修的大脑反应。结果证明，信仰与禅修经验确实可以提升大脑的变化，并改善身心的健康。那么持咒呢？
《打造赢家的脑》 (The Winner ’ s Brain) 作者之一的加拿大神经科学家芬斯基，曾扫描正在持咒的大脑。结果发现当持咒者专心于咒文时，他们大脑专注力连接的前额叶、顶叶都更可活化，而掌管情绪的杏仁核则降低了活化，能让人产生宁静。
换句话说，当耳朵接受到咒语音声时，讯息会先入到左脑，左脑会尝试去分析，但由于咒语通常不翻，只是音节韵律；然而，当反复、专心诵经，左脑慢慢减缓作用，而透过掌管声音的皮质层传递给右脑，让额叶更容易输送阻力脉动到杏仁核，让身体和精神平静下来，甚至产生与宇宙共振之感。
许多科学家深信爱因斯坦的相对论主张（宇宙的一切都是由能量构成），这也包括不可见，透过振动频率而产生的能量，咒语即是属于声音震动所产生的能量；宇宙意识是音波频率，咒语也是音波频率，当频率相等时，就因共鸣相应，可产生不可思议的效力。例如咒语中常见的 唵 Om 这个单音节，即被视为宇宙原始生命能量的根本音。
2009 年，美国加州大学洛杉矶分校医学院神经学系助理教授陆得斯 (Eileen Luders ) 以核磁共振造影，持续十年追踪持咒者对大脑产生的影响，也发表多篇论文，发现当注意力在咒语时，大脑确会做出调节，释放压力，让人更专注。这份专注强化神经元，加强大脑的连结，从左脑进入右脑，人更容易与宇宙力量接轨，以宗教立场来说，应该是接近 ( 定 ) 。
—— 《人生》杂志
