《细胞》发表医学研究院肖锐课题组最新研究成果

28.06.2019  18:20

新闻网讯(通讯员叶雯)6月27日, Cell (《细胞》)以长文(Article)形式在线发表了我校医学研究院、免疫与代谢前沿科学中心肖锐研究员与美国加州大学圣地亚哥分校(UCSD)付向东教授课题组的最新研究成果。

论文题为“Pervasive Chromatin-RNA Binding Protein Interactions Enable RNA-based Regulation of Transcription”《RNA结合蛋白广泛地与染色质相互作用以实现RNA介导的转录调控》。肖锐是该文的共同第一作者和通讯作者。

RNA结合蛋白在转录后的剪接加工、修饰、转运、细胞定位、稳定性、翻译和降解等RNA代谢过程中发挥着重要的调控功能,但其在转录水平的调控功能和机制尚未有系统的研究。通过ChIP-seq(染色质免疫沉淀测序)技术大规模检测了63个有细胞核定位的RNA结合蛋白与染色质的相互作用,肖锐研究员等意外地发现约60%的RNA结合蛋白与染色质有广泛的相互作用,并且富集在基因启动子和增强子区域。

更令人惊讶的是,该研究虽然只检测了人类基因组中一小部分的RNA结合蛋白(<5%),却发现约40%的活性染色质区域和约70%的活性启动子区域都存在RNA结合蛋白的特异性结合,这提示RNA结合蛋白在染色质水平存在着广泛的功能和作用。随后,通过GRO-seq(Global Nuclear Run-On测序)实验证实,部分RNA结合蛋白具有强烈的转录调控作用。

该研究还重点阐释了RNA结合蛋白RBM25通过调控转录因子YY1与染色质的结合,进而调控染色质结构和转录激活与抑制的分子机制,全面展示了特异性的RNA结合蛋白介导的转录因子YY1的功能调控作用。整个发现提出了RNA结合蛋白作为转录因子或辅助因子调控转录的新概念,也开辟了RNA结合蛋白功能研究的新领域。

肖锐研究员是医学研究院2017年引进的优秀归国人才,本科和博士毕业于武汉大学生命科学学院,博士和博士后期间师从RNA研究领域专家UCSD的付向东教授,至今一直专注于自己热爱的RNA生物学和功能基因组学领域开展研究工作,并取得了一系列重要的成果。近年来,肖锐研究员作为第一作者和通讯作者在 Cell (1篇), Nature (2篇)和 Molecular Cell (2篇)等顶尖期刊上发表了多篇高水平研究论文。

美国加州大学圣地亚哥分校陈加余博士和梁征宇博士为该论文共同第一作者,付向东教授为共同通讯作者,共同作者包括武汉大学周宇教授和罗大极副教授,清华大学鲁志教授、张奇伟教授和陈阳助理研究员,厦门大学刘文教授,美国MIT Christopher Burge教授,UCSD Gene Yeo教授,康涅狄格大学Brenton Graveley教授和加拿大蒙特利尔大学Eric Lecuyer教授。该工作得到了国家自然科学基金以及武汉大学“双一流”人才科研启动经费的资助。

原文链接: https://doi.org/10.1016/j.cell.2019.06.001

(供图:医学研究院  编辑:陈丽霞)